Hej Totte!
Om du är osäker på något, som t.ex. THM-filerna, kan du alltid testa. Jag gjorde det nyss. Jag tog bort THM-filerna i en rutt (gjorde en backup först!). Det jag märkte var att inga byggnader gick att sätta ut. Så låt THM-filerna vara, jag tror dom har med placeringen av byggnader och objekt (rätta mig om jag har fel?) och inte med hur många S-filer du/man har.
Dom andra problemen vet jag tyvärr inte vad det beror på. Men om det saknas en fil, så borde det stå i felmedelandet, vilken fil som saknas. Och det är viktigt att spara och göra backup ofta. Då kan man bara lägga in kopian och fortsätta, när det blir något fel!
http://pirpen.cjb.net/